NAKAI Lab.
Laboratory of Functional Analysis in silico
Human Genome Center
The Institute of Medical Science
The University of Tokyo
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O foco do nosso laboratório é a análise funcional da informação genética, bem como dos produtos da expressão dos genes, utilizando métodos computacionais (métodos in silico).
Com a disponibilidade das sequências genômicas de organismos modelo e da viabilidade do sequenciamento de genomas individuais, a investigação para elucidar os mecanismos envolvidos em doenças e decifrar o código genético de uma grande quantidade de dados genômicos, se tornou uma importante área de pesquisa. O avançado processamento de informação de grandes quantidades de dados genômicos desempenham um importante papel nesta área de pesquisa. Pela primeira vez, questões como “Como são controladas as expressões dos genes?” e “Como isso conduz a fenótipos distintos?” são abordadas nesta área. Acreditamos que o perfil da expressão de genes, a modelagem da estrutura de promotores e a criação de bancos de dados de interações proteína-proteína utilizando dados de experimentos com a tecnologia de alto rendimento são abordagens eficazes para responder a estes problemas desafiadores. Fazemos uso de métodos computacionais para abordar estas questões.
Trabalhando em colaboração com biologistas experimentais, analisamos os dados provindos de sequenciadores de nova geração a fim de elucidar os mecanismos envolvidos em doenças, estudar a resposta imune e fornecer insights no campo da medicina regenerativa.
A bioinformática é um campo interdisciplinar de pesquisa. Os assistentes e estudantes de pós graduação em nosso laboratório, além possuírem diferentes formações acadêmicas, também são de diferentes partes do mundo. Se você quiser se juntar ao nosso laboratório como um estudantes de pós-gradução, você pode se inscrever em qualquer um dos dois departamentos: no Departamento de Ciência da Computação do Programa de Pós-Graduação em Ciência da Informação e Tecnologia, ou no Departamento de Biologia Computacional e Ciências Médicas do Programa de Pós-Graduação das Ciências Fronteiriças, ambos pertencentes à Universidade de Tóquio. Àqueles estudantes interessados nos campos de biologia, computação e matemática, que tenham especial interesse em estudar os fenômenos biológicos, são muito bem vindos em nosso laboratório. Também recebemos pós-doutorados talentosos que estão interessados em conduzir seus próprios projetos de pesquisa.
Todos os integrantes do laboratório são incentivados a debater sobre as suas investigações tanto com seu supervisor diretamente, como com os colegas de laboratório em qualquer momento que achar conveniente. Em nosso laboratório realizamos seminários regularmente e estamos participando ativamente de apresentações orais ou de pôster, assim como em conferências realizadas tanto no Japão com fora do território nacional. Além disso, vários artigos são publicados em periódicos e revistas internacionais com alto fator de impacto. Nosso laboratório tem acesso ao supercomputador do Instituto de Ciências Médicas da Universidade de Tóquio. O espaço físico deste laboratório está dividido em pequenas áreas de trabalho (cubículos) para cada membro (o que permite trabalhar com certa privacidade e conforto) e conta também com uma sala de reuniões e duas salas de seminários. Além disso, temos uma maravilhosa vista da Tokyo Tower e Tokyo Skytree.
Se ficou interessado em nosso trabalho e pensa em se unir ao nosso laboratório ou possui qualquer dúvida, por favor entre em contato conosco ou venha nos visitar.
Estamos ansiosos para recebê-lo em nosso grupo!
Laboratório de Análise Funcional in Silico
Professor Kenta Nakai